La descentralización del Estado y del sector salud en Colombia se inicia desde finales de la década de los 80s, y a partir de 1993 se ha llevado a cabo concomitantemente con la implementación del Sistema General de Seguridad Social en Salud, mediante el cual se introdujo una amplia reforma al sector salud y los municipios y departamentos asumen nuevas competencias.Tanto el Sistema General de participaciones, como las funciones políticas y administrativas transferidas han generado complejas relaciones intergubernamentales en las cuales no solo interactúan los agentes de gobierno sino también actores privados, organizaciones comunitarias y partidos políticos, entre otros. La fragmentación de actores y competencias y la necesidad de economías de escala han sugerido la necesidad de generar relaciones intergubernamentales más cooperativas entre municipios de la misma región. Sin embargo los intereses políticos de los grupos y barreras legislativas hacen difícil la puesta en marcha de estrategias en este sentido.

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